エックスサーバを初めて使って、mysqlの管理アプリがphpmyadminしかない。
phomyadminはださくて使いたくない。
sequel proが使いたい。
ちょっと、調べてみたら
さくらサーバーのphpMyAdmin(MySQL)に『sequel pro』っていうデータベー… – Yahoo!知恵袋
さくらに限らずほとんどのレンタルサーバはそういう対策をしているハズです。逆に言えばwebサーバでの利用を前提としているMySQLなので（外部からのアクセスに対して）ポートを開ける意味がありません。
サーバ側でポートが開いていないのですから、どうやっても繋げません。
規約上外からは接続できませんとなっているのにこのような質問するのもどうかと・・・。
適当な答えばかりですが、普通に接続できました。
知恵袋あてにならん。